大型荟萃分析,30多个基因与偏头痛有关!!

时间:2018年05月16日 08:58作者:美安预约网

来自于国际头痛基因组学会(International Headache Genetics Consortium)的研究人员对其中22项GWAS研究进行了大型荟萃分析,并揭示了44个基因位点与偏头痛风险相关的单核苷酸的多态性,其中定位到了38个基因位点,同时其中包括28个新位点,位点富集的基因都在血管与平滑肌组织中表达。研究结果发表在《自然基因》杂志(《自然基因Nature Genetics》是一部英国自然出版集团的杂志。ISSN是1061-4036(print))上。

美国马萨诸塞州/麻省总医院和哈佛医学院的Aarno Palotie与他的同事们在文章中描述到,“研究鉴定出了38个基因组位点同时佐证了一种说法,血管与平滑肌组织中的基因与偏头痛发病机制相关,主要的两种偏头痛类型(有先兆偏头痛和无先兆偏头痛)有一些共享的潜在的可遗传基因的存在。”

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1.38个偏头痛易感相关基因位点

Palotie与他的同事们已经收集了22项GWAS研究结果,这其中包含了将近6万个有先兆或无先兆偏头痛的患者,以及31万6千个对照人群,所有研究对象都来自具有欧洲血统的。他们利用万人基因组的计划来参考panel并填补缺失的基因。

初步分析,研究人员将来自800多万个基因进行的检测,共检测到44个全基因组范围内独立的显著单核苷酸的多态性。把邻近的相关联位点进行合并后,随之他们发现了与偏头痛相关的38个基因组,其中28基因个为新发现的与偏头痛相关。研究表示,之前研究中发现的与偏头痛相关的13个基因位点中10个基因位点得到了证实。

研究还进行了对偏头痛亚支的关联联系分析。最常见的一种类型为无先兆偏头痛占比60%以上,他们对这种类型进行分析并鉴定出了7个基因显著位点,这7个基因位点在初始分析中就已经被发现。然而他们并未发现与有先兆偏头痛特异相关的位点.可能是因为此次样本规模较小有关。特异性分析结果显示大多数发现的位点与这两种偏头痛亚型均有联系。

2.偏头痛在血管与平滑肌组织中的因子有联系

研究表示,这38个位点中有84%都与蛋白质编码基因转录发生重叠,在这些重叠区有45%的区仅仅只含有1个基因。这38个位点中有2个与离子通道基因有关联,同时大大降低了偏头痛可能是一种离子通道相关疾病的这种假说的可能。

在这些基因中很多都过去被报导和血管疾病有关,比如PHACTR1基因、TGFBR2基因加上HEY2基因,那么其他基因则与平滑肌收缩与调节血管张力有关,比如MRVI1基因、GJA1基因与NRP1基因。

利用来自于基因型-组织表达学会项目的数据,研究发现一些疾病相关基因在个别些组织中表达量出现更高。比如GPR149基因、CFDP1基因与DOCK4基因在大脑中的高表达,而PRDM16基因、MEF2D基因与FHL5基因在血管组织中高表达。

Palotie及其他的同事们还寻找了这38个关于偏头痛基因组高表达组织。对于这个分析,他们发现表达最高的组织是部分来自于心血管系统,其中消化系统也同样出现了基因富集的情况。他们利用DEPICT和独立芯片数据集来反复测算进而得到了这个结果。

再进一步利用GO过表达的分析与DEPICT二项次分析,来表明了心血管组织的相关性。研究指出,这些和血管组织相关发现和偏头痛并发症以及之前报导的偏头痛中风加上心血管疾病均承担多基因风险是具有一致性的。

最后Palotie与他的同事们讲道,“这些结果都表现血管功能障碍和平滑肌功能障碍都和偏头痛发病机制有关。”同时,他们又补充道,神经机制同样可能与偏头痛有关。

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